临床药学与药事管理学系于2007年6月在原临床药学教研室与药事管理学教研室基础上组建成立。现任系主任为何金汗教授，常务副主任为胡明教授。
原华西药学院临床药学教研室是国内著名的最早从事临床药学宣传和教育的基地之一，也是我国最早开展新药临床药动学与药物制剂生物利用度评价研究、并为本科生开设“生物药剂学”、“药动学”课程的单位之一，是我国临床药学学科发源地。1989年原华西医科大学在国内率先设置5年制临床药学专业，并面向全国招生。1996年，成立临床药学教研室。2004年设置临床药学专业硕士与博士培养点。2011年在临床药学科研团队基础上组建临床药学研究中心。
原华西药学院药事管理学教研室于1985年成立，是我国最早设立的药事管理学教研室，并于同年在国内首次开设了《药事管理学》课程，是我国药事管理学科发源地。2004年设置药事管理学专业硕士、博士培养点。2015年在原药事管理科研团队基础上组建药物政策与药物经济学研究中心。
临床药学与药事管理学系现有专职在职教师10人，其中博士导师6人，硕士导师2人；兼职教师20余名，其中博士导师5人、硕士导师3人。在学科与专业的建设中，我院与华西医院药学部、华西二院药学部携手合作，开展临床药学与药事管理学的教学与科研工作，承担临床药学专业本科生与研究生培养任务。目前，我系共承担临床药学和药学专业本科教学的21门课程及研究生10门课程的教学工作；每年招收博士8-10人、硕士12-15人；已毕业200余位硕士和30余位博士。
临床药学与药事管理学系是我院临床药学专业建设的主要承担机构。自1989年在国内率先招收临床药学专业学生以来，经30余年的努力探索，为我国临床药学学校教育和人才培养积累了经验。目前，我系围绕临床药学专业已形成运转高效的教学组织、系统完善的专业课程体系、完善严谨的教学质量持续改进机制，2019年临床药学专业获批四川省一流专业，2020年获批国家一流专业。临床药学专业定位于面向健康中国战略发展需要和合理用药需求，以特色和创新为引领，立足西部，辐射全国，培养具有崇高理想信念、深厚人文底蕴、扎实专业基础、突出实践和创新能力，“医药融合，懂医精药”并追求卓越的高素质临床药学专门人才。临床药学学科建设目标和临床药学专业建设定位是：围绕新医科建设理念，以人才培养为中心，以加强内涵建设为主题，以服务地方经济和社会发展为主线，以师资队伍建设为根本，推动科研水平、教学质量和临床药学人才培养水平的全面提高；将临床药学专业建设成为国内领先、国际一流、特色鲜明的标杆专业。
我系的临床药学研究以关注药物应用环节与应用结果为特色，主要涉及内分泌药理学、老年人合理用药、生物药剂学、药动学、药物临床评价、循证药学、药物治疗学、药品临床应用管理及临床药学教育等方面；药事管理学研究主要围绕药物经济学、药物政策与法规、药品监管科学、药学教育及学科建设研究等开展。近年来，共主持并完成有国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金重点项目及多项国家自然科学面上项目和百余项新药非临床药动学、临床药动学、生物利用度评价、药物经济学评价、药品监管制度建设与评价等研究课题；曾多次获得卫生部与四川省科学技术进步奖。我系教师在国内外公开发表相关学术论文800余篇，主编、副主编或参编20余部国家级规划教材或专著；多次应邀在国际、国内学术大会上做主题报告；多次获得省级、校级教学成果奖。